Στην Ιερά Σύνοδο υπάρχει Γενική Γραμματεία, για να τη βοηθεί στο έργο της. Πρώτος Υπεύθυνος της Γραμματείας είναι ο εκάστοτε Πρόεδρος της Ιεράς Συνόδου. Κάθε τρία χρόνια εκλέγεται ο Αρχιγραμματέας ο οποίος και βοηθείται στο έργο του από τον ειδικό Γραμματέα.
Αρχιγραμματέας: Σεβ/τος Ιωσήφ Πρίντεζης
Διεύθυνση Τήνου : Παλλάδα – Χώρα Τήνου Τ.Κ. 84200 ΤΗΝΟΣ
Ταχ. Διεύθυνση : Τ.Θ. 24, Τ.Κ. 84200 ΤΗΝΟΣ